平行自愿的投档原则是“分数优先，遵从自愿，一轮投档”。即对同一批次线上未被选取的考生，按成果从高分到低分排序，进行一次性投档。在本科平行投档时，计算机将依据考生填写的自愿次序，投档到排序在前且有方案余额的高校。例如，某考生填写的自愿为A、B、C、D等院校，投档时，先将该批次线上考生按分数大排队，然后由计算机顺次检索考生自愿。若考生契合A校投档条件且A校有方案余额，则投档到A校；若不契合A校的投档条件，则持续检索B校，若契合B校投档条件且B校有方案余额，则投档到B校，以此类推，直至检索完考生所填写的一切院校自愿。一旦档案投出，便不再检索该考生的其它自愿，该考生的投档流程即完结，随后开端检索下一名考生，直至完结本批次最终一名考生的投档作业。